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2019年1月19日 星期六

用Gaussian算angle constant

Gaussian套裝軟體是利用量子力學原理計算原子、分子的各式性質。因此,下面要介紹如何求水分子的平衡鍵角以及鍵角常數。

用Gaussian view畫出一團水分子
























為了加快運算,我選擇Hartree Fock來計算potential energy surface (PES),
Basis Sets選6-31G,角度從60掃到160,下面是我的script檔:

%nprocshared=4
%mem=200MW
%chk=C:\Users\Lynn\Desktop\gaussian.chk
# opt=modredundant hf/6-31g geom=connectivity

Title Card Required

0 1
O 0.00000000 0.00000000 0.17474200
H 0.00000000 0.50443600 -0.69896700
H 0.00000000 -0.50443600 -0.69896700

1 2 1.0 3 1.0
2
3


A 2 1 3 S 100 1.000000

跑完之後Results->Scan可以得到下面angle potential vs. theta的趨勢圖


結果平衡角度是111.5與理論值109.5大約差2度。
從上圖迴歸可以得到Angle constant,公式如下;
> y=K(theta-theta0)^2
> logy=logK+2*log(theta-theta0)
(Hartree=627.509 kcal mol-1)

不過,負值的harmonic angle potential似乎是錯的...............................
未完待續

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