首先,最好將Ubuntu更新到最新版本,並使用NAMD的最新版本。 由於我們需要C&C ++編譯器來構建NAMD二進制源代碼
$ sudo apt-get install gcc
$ sudo apt-get install g++
$ sudo apt-get install csh
$ sudo apt-get install tcsh
下載檔案後解壓縮
$ tar -xvf NAMD_2.13_Linux-x86_64-multicore-CUDA.tar.gz
$ cd NAMD_2.13_Linux-x86_64-multicore-CUDA
$ sudo cp namd2 /usr/local/bin/namd2
$ sudo cp charmrun /usr/local/bin/charmrun
參考
https://www.researchgate.net/post/Problem_on_installing_NAMD
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